http://dev.mysql.com/downloads/mysql/5.1.html pa uradi search za "embedded" u browseru :) (ah, sad vidim da si nasao)
obrati paznju, za razliku od servera, koji mozes da koristis uz tvoju aplikaciju koja je proprietary, closed source, za pare i slicno .. embedded ne mozes! ... dakle, ako ukompajliras embedded mysql u svoju aplikaciju ta aplikacija mora da bude gpl / open source ili moras da platis licencu za embedded server. Vidim da za sada oces da radis neko testiranje i eventualno neki razvoj, tako da cisto hocu da ti bacim taj info unapred, da ne bi posle imao problema (kada sve "odlucis", "napravis" i budes trebao da prodajes).
Imas "neke druge" db servere koji mogu da odrade dobar deo posla u embedded okruzenju a ne postavljaju ti taj "problem" sa placanjem licence koji imas sa mysql-om...
( pogledaj: http://www.sqlite.org/ )