Primeri zločina za koje se Šešelj tereti:
Proganjanje na političkoj, rasnoj i religioznoj osnovi, deportacije, nehumane aktivnosti (nasilni transferi) (zločini protiv čovečnosti).
Ubisto, mučenja, okrutni tretmani, uništavanje naselja, prekomerna upotreba sile koja nije opravdana vojnim potrebama, uništavanje institucija verske i obrazovne namene, uništavanje javne ili privatne svojine, kršenje običaja ratovanja.
Od oko 1 avgusta 1991 do septembra 1993. Vojislav Šešelj, delujući individualno ili u sadejstvu sa poznatim ili nepoznatim pripadnicima udruženog zločinačkog poduhvata, planirali su, naredjivali, fizički činili progon Hrvata, Muslimana i drugih gradjana ne-Srpske nacionalnosti na teritoriji koju su srbijanske vlasti označili kao "Srpska Autonomna Oblast Slavonije, Baranje i Zapadnog Srema" i oblasti Zvornik, "Veliko Sarajevo" (Ilijaš, Vogošća, Novo Sarajevo, Ilidža i Rajlovac), Mostar, Nevesinje, BiH i delovi Vojvodine. Ova proganjanja su činjena na političkoj, rasnoj i verskoj osnovi i obuhvatala je:
- Ubistva mnogih Hrvata, Muslimana i drugih ne srpskih civila, uključujući žene i stare osobe u oblasti Vukovara, Zvornika, "Velikog Sarajeva", Mostara i Nevesija;
- Produženo i rutinsko zatvaranje Hrvata, Muslimana i drugih ne srpslih civila uhvaćenih u Hrvatskoj i BiH, uključujući i osobe u Vukovaru, Zvorniku, "Velikom Sarajevu", Mostaru i Nevesinju;
- Uspostavljanje nehumanih uslova za život za Hrvate, Muslimane i ostale ne srpske civile unutar zarobljeničkih logora;
- Ubistva i ponovljene torture i prebijanja Hrvata, Muslimana i drugih ne srpskih civila zarobljenih unutar zarobljeničkih logora;
- Produžen i čest prisilni rad Hrvata, Muslimana i drugih civila ne srpske nacionalnosti zarobljenih ili u kućnom pritvoru u Vukovaru, Zvorniku, "Velikom Sarajevu" i Mostaru. Prinudni rad je uključivao kopanje grobova, punjenje municije za srpske vojne formacije, kopanje rovova i druge oblike manuelnih radova na ratištu;
- Silovanja Hrvata, Muslimana i drugih ne srpskih civila od strane srpskih vojnika tokom zarobljeništva i u zarobljeničkim logorima;
- Nametanje ograničenja i diskriminatornih mera protiv Hrvata, Muslimana i drugih ne srpskih civila, uključujući osobe u Zvorniku, "Velikom Sarajevu", Mostaru i Nevesinju, i u delovima Vojvodine (Hrtkovci, Nikinci, Ruma, Šid i druga naselja koja se graniče sa Hrvatskom), kao što su ograničavanje kretanja, uklanjanje iz centara moći u lokalnim vladinim institucijama i u policiji, otpuštanja s posla, odbijanje medicinskih usluga, i proizvoljno pretraživanje domova;
- Torture, prebijanje i pljačkanje Hrvata, Muslimana i drugih civila ne srpske nacionalnosti;
- Deportacije ili prinudni transfer desetina hiljana Hrvata, Muslimana i drugih civila ne srpske nacionalnosti sa teritorija koje su navedene;
- Namerno uništavanje domova, druge javne i privatne imovine, kulturnih institucija, istorijskih zdanja i svetih mesta Hrvata, Muslimana i drugih civila ne srpske nacionalnosti u oblastima Vukovar, Zvornik, "Veliko Sarajevo", Mostar i Nevesinje;
- Direktno i javno klevetanje kroz "govor mržnje" u odnosu na Hrvate, Muslimane i drugo stanovništvo ne srpske nacionalnosti u Vukovaru, Zvorniku, Hrtkovcima na osnovu njihove etničke pripadnosti;
http://www.icty.org/x/cases/seselj/cis/en/cis_seselj_en.pdf